
Setahun setelah Paus Paulus III menyetujui Serikat Yesus, para Yesuit memilih Ignatius Loyola sebagai Superior Jenderal Serikat mereka pada tahun 1541. Ignatius mencoba menolak pengangkatan ini, tetapi setelah ia terpilih tiga kali, ia menerima bahwa ini adalah kehendak Tuhan baginya dan para Yesuit. Pria yang pertama kali bermimpi melayani Tuhan di Yerusalem dan kemudian menyebarkan Injil ke seluruh dunia ini, sebagian besar, tidak akan bepergian lebih jauh dari Roma selama sisa hidupnya.
Namun, Ignatius, sebagai Bapa Umum, akan mendukung dan membimbing ratusan imam Yesuit yang melakukan perjalanan jauh untuk menyampaikan Injil dan mengajarkan iman. Kita mengetahui setidaknya 7.000 surat yang ditulisnya kepada mereka yang melayani dalam misi Yesuit dan kepada orang lain yang bersamanya sebagai teman dan/atau pembimbing spiritual.
Para imam Yesuit termasuk di antara para pelayan Kristen pertama yang beradaptasi dengan budaya lain untuk memajukan kerajaan Allah. Di mana pun mereka berada, mereka mempelajari bahasa dan berpartisipasi sebisa mungkin dalam urusan budaya dan publik. Mereka menjadi pembuat peta dan ahli matematika, astronom, ahli bahasa, dan dokter.
Serikat Yesus dikenal karena banyaknya sekolah dan universitas Yesuit yang telah didirikan. Namun, aspek kelembagaan Yesuit ini bukanlah bagian dari rencana awal siapa pun. Para Yesuit mulai mendidik para pemuda untuk mempersiapkan mereka lebih baik untuk pembentukan mereka sebagai imam. Akhirnya, orang-orang meminta pendidikan berkualitas tinggi ini untuk anak-anak mereka, terlepas dari apakah mereka akan memasuki imamat atau tidak. Saat ini, kebanyakan orang berpikir tentang universitas ketika mendengar istilah Yesuit . Atau mereka berpikir tentang misionaris awal ke Jepang, Cina, dan penduduk asli di Amerika.
Selain kegiatan misi Serikat Yesus, dapat dikatakan bahwa kontribusi Ignatius Loyola yang paling berpengaruh adalah Latihan Rohani, yang ditulis dalam bentuk kasar selama masa sulit dan mencerahkannya di gua Manresa dan kemudian disetujui oleh Paus Paulus III pada tahun 1548. Sebagian besar dari apa yang kita sebut bimbingan rohani saat ini tumbuh dari prinsip-prinsip yang diuraikan Ignatius dalam dokumen yang relatif singkat ini. Ignatius tidak menciptakan prinsip-prinsip ini, dan mungkin dia bukanlah orang pertama yang menemukannya dan meneruskannya kepada orang lain. Namun, bentuknya, seperti yang diberikan dalam Latihan Rohani, telah membantu jutaan orang untuk memperhatikan pertumbuhan dan pemahaman rohani mereka.